Начало медицинского обслуживания населения на территории нынешнего района связано с именем золотопромышленника М.Колобова, который в 1890 г. открыл в с. Каратузское фельдшерский пункт. Помещался он в небольшом жилом домике, где одна из комнат была приспособлена для работы фельдшера. Первоначально лечебный пункт предназначался для рабочих и служащих Уджейского винокуренного завода, которым владел Колобов, озабоченный частыми болезнями своих работников, в результате чего падала производительность на предприятии. Со временем здесь начали лечить жителей с. Каратузское и других близлежащих населенных пунктов Сагайской волости.
Когда Минусинский округ был реорганизован в уезд (1898 г.) создается 4-й врачебный участок по медицинскому обслуживанию жителей Сагайской волости, население которой к этому времени составляло более 23 тыс. чел. В 1899 г. в с. Каратузское открывается участковая больница на 6 коек. Располагалась она в двух частных домах, в одном из которых велся прием больных, в другом было стационарное отделение. Штат больницы состоял из четырех специалистов. Первым врачом был Д.И.Попов, помогали ему фельдшеры А.И.Миндек и О.И.Поляков. Фельдшером-акушеркой работала Е.А.Коршунова.
В 1900 г. в с. Каратузское прибывает выпускник Томского университета Н.Ф.Николаевский, назначенный врачом 4-го врачебного участка, в территорию которого входили Сагайская, Верхнекужебарская и Моторская волости. После того как Николаевский женился на дочери предпринимателей Колобовых, вдова Клавдия Степановна Колобова-Юшкова (внучка декабриста Н.О.Мозгалевского), ставшая к этому времени владелицей Владимирского (Уджейского) винокуренного завода, дарит в конце 1904 г. своему зятю под лечебницу большое деревянное здание (378,8 кв. м), сохранившееся до настоящего времени (см. «Памятники района»).
В новом здании участковая больница была расширена до 15 коек, при ней открылась лаборатория. В эти же годы (начало ХХ в.) открываются врачебные пункты Переселенческого Управления в с. Моторское, деревнях Колеватовка и Сосновка.
В 1906 г. уже произведенный в чин надворного советника, врач 4-го врачебного участка Минусинского уезда Н.Ф.Николаевский избирается депутатом I-й Государственной Думы от Енисейской губернии (см. «Персоналии») и покидает с. Каратузское. В последующие два года медицинскую помощь жителям Сагайской волости оказывали фельдшера И.Ф.Мартынюк и Д.И.Епифанов.
После роспуска I Госдумы Н.Ф.Николаевский на какое-то время возвратился к месту прежней службы, но врачебной практикой практически не занимался. Жил в основном в с. Уджей, где вел агитационную работу на винокуренном заводе, призывая рабочих к свержению самодержавия. В 1907 г. выехал в неизвестном направлении, дальнейшая его биография неизвестна. Следует отметить, что фельдшер И.Ф.Мартынюк, работавший в Каратузской больнице с 1905 г. по 1937 гг., имел такой опыт и знания, что небезуспешно заменял врача.
В 1908 г. прибывает дипломированный врач А.П.Лебедев, работавший здесь до декабря 1921 г. на посту главного врача. Затем его сменяет Ф.И.Гуров. По инициативе последнего были построены новые здания под амбулаторию и стационарную больницу, получившую к тому времени статус районной. Старое здание прежней лечебницы вплоть до 1960-х гг. использовалось под роддом и детское отделение.
В годы работы главным врачом района А.Ф.Горна (1940-е – нач. 1950-х) открыты участковая больница в с. Моторское, в ряде сел – фельдшерские пункты.
В последующие годы здравоохранение района получает дальнейшее развитие. В 1960 г. сеть медицинских учреждений состояла из районной больницы на 87 коек, четырех участковых больниц (общее число коек – 30), четырех фельдшерско-акушерских пунктов и одного фельдшерского пункта. В районе работали 14 врачей и 72 чел. среднего медицинского персонала.
С 1961 г. по 1975 гг. здравоохранение района возглавлял врач-отоларинголог И.Ф.Смятских. В этот период в с. Моторское строится типовая участковая больница с амбулаторией, стационарным отделением, ренгенкабинетом. Здесь же открывается инфекционное отделение, для которого построено специальное здание (многие годы оно было отделением центральной районной больницы). В районном центре поострены новое здание ЦРБ, отделение скорой медицинской помощи. К 1970 г. в районе насчитывалось 18 врачей по 10 специальностям, 132 чел. среднего медперсонала.
Работа в новых экономических условиях, наступивших в 1990-х годах, стала причиной изменения структуры районного здравоохранения, новой организации медицинского обслуживания населения. Участковые больницы в селах Качулька и Нижние Курята реорганизованы во врачебные амбулатории. Произошло сокращение койко-мест и перепрофилирование в Моторской участковой больнице.
Тем не менее, в условиях ограниченного финансирования, несмотря на трудные экономические условия руководством района постоянно проводится работа по укреплению материально-технической базы участковых больниц, врачебных амбулаторий и ФАПов, которые оснащены современным медоборудованием, укреплены квалифицированными кадрами. В Нижнее-Курятской и Моторской участковых больницах открыты стоматологические кабинеты. Открыт ряд новых кабинетов в ЦРБ (УЗИ-диагностики, офтальмологический, клинико-диагностической лаборатории и др.). В 2001 году сдано новое здание поликлиники и в 2007 году отремонтировано старое здание поликлиники.
В настоящее время сеть медицинских учреждений района представлена:
- Каратузской центральной районной больницей на 130 коек с 7 отделениями различного направления;
- Районной поликлиникой;
- Моторской участковой больницей на 25 коек сестринского ухода;
- Верхнее-Кужебарской участковой больницей на 10 коек;
- Двумя врачебными амбулаториями (в Качульке и Нижних Курятах);
- 19 фельдшерско-акушерскими пунктами.
Каратузская ЦРБ имеет лицензии на 65 видов и профилей медицинской деятельности. Из 35 врачей, работающих в районе, 11 имеют высшую квалификационную категорию и 11 – первую. Из 177 средних медицинских работников квалификационную категорию имеют 110 человек.